行政院長劉兆玄今天下午召開記者會，宣佈向總統請辭獲准，表示從上任以來即接受許多挑戰，內閣的基本策略皆是希望能在危機中找到轉機，包括油價上漲、金融風暴等問題皆是如此應變，八八水災對他來說，是一個刻骨銘心的沉痛，他公開謝謝所有宗教領袖在救災重建中給予精神上的支持，對於重建，劉揆說，政府要給災民同胞的，不只是一個房子，而是一個家園，這樣才會是化危機為轉機的典範。劉揆最後以天祐中華民國，結束整個談話。

    劉兆玄周四將率內閣總辭。總統府發言人王郁琦七日傍晚召開記者會，並同時宣布新內閣人事，國民黨副主席兼秘書長吳敦義確定接任閣揆，桃園縣長朱立倫接任副閣揆。

    王郁琦在記者會中肯定劉內閣政績，並表示劉揆為了負起政治責任，早在八月中就已經向馬總統請辭，當時馬總統懇辭慰留，勉勵他忍辱負重，等救災告一段落後再談內閣人事問題，但劉兆亦仍堅持九月初要負起政治責任。

    王郁琦表示，馬總統對劉揆不改初衷，堅持承擔政治責任，留下最高行政首長有為有守的典範，令人敬佩。

    王郁琦宣布，行政院長一職由吳敦義接任，朱立倫任行政院副院長，吳敦義也將於稍後召開記者會，宣布今後大政方針。